Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RUNDC3BQ96NL0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNDC3BQ96NL0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms