Protein–RNA interactions for Protein: Q96N95

ZNF396, Zinc finger protein 396, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF396Q96N95 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF396Q96N95 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms