Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms