Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RNFT2Q96EX2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RNFT2Q96EX2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms