Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RTP4Q96DX8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTP4Q96DX8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms