Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFT1Q96AA3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms