Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM54Q969K7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
TMEM54Q969K7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM54Q969K7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM54Q969K7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM54Q969K7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM54Q969K7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM54Q969K7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM54Q969K7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM54Q969K7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM54Q969K7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM54Q969K7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM54Q969K7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM54Q969K7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM54Q969K7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms