Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC36.03■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC36.02■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC36.02■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
TRIM41Q8WV44 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC36■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC36■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC36■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC36■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.99■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC35.97■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC35.96■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC35.95■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
TRIM41Q8WV44 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC35.95■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC35.94■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms