Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms