Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEY3

SPATA4, Spermatogenesis-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA4Q8NEY3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms