Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN5

PDPR, Pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPRQ8NCN5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms