Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN4

RNF169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF169Q8NCN4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF169Q8NCN4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms