Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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