Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SVOPQ8N4V2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SVOPQ8N4V2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SVOPQ8N4V2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SVOPQ8N4V2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SVOPQ8N4V2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SVOPQ8N4V2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SVOPQ8N4V2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SVOPQ8N4V2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SVOPQ8N4V2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SVOPQ8N4V2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SVOPQ8N4V2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SVOPQ8N4V2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SVOPQ8N4V2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SVOPQ8N4V2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SVOPQ8N4V2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SVOPQ8N4V2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SVOPQ8N4V2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SVOPQ8N4V2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SVOPQ8N4V2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SVOPQ8N4V2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SVOPQ8N4V2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SVOPQ8N4V2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SVOPQ8N4V2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SVOPQ8N4V2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SVOPQ8N4V2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SVOPQ8N4V2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SVOPQ8N4V2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SVOPQ8N4V2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SVOPQ8N4V2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SVOPQ8N4V2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SVOPQ8N4V2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SVOPQ8N4V2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SVOPQ8N4V2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SVOPQ8N4V2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SVOPQ8N4V2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SVOPQ8N4V2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SVOPQ8N4V2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SVOPQ8N4V2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SVOPQ8N4V2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SVOPQ8N4V2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SVOPQ8N4V2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms