Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPAP2Q8IXW5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms