Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV77

CNGA4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA4Q8IV77 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGA4Q8IV77 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms