Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
YTHDF3Q7Z739 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
YTHDF3Q7Z739 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
YTHDF3Q7Z739 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
YTHDF3Q7Z739 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
YTHDF3Q7Z739 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
YTHDF3Q7Z739 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
YTHDF3Q7Z739 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
YTHDF3Q7Z739 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
YTHDF3Q7Z739 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
YTHDF3Q7Z739 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
YTHDF3Q7Z739 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
YTHDF3Q7Z739 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
YTHDF3Q7Z739 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
YTHDF3Q7Z739 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
YTHDF3Q7Z739 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
YTHDF3Q7Z739 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
YTHDF3Q7Z739 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
YTHDF3Q7Z739 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
YTHDF3Q7Z739 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
YTHDF3Q7Z739 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
YTHDF3Q7Z739 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
YTHDF3Q7Z739 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
YTHDF3Q7Z739 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
YTHDF3Q7Z739 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
YTHDF3Q7Z739 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
YTHDF3Q7Z739 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
YTHDF3Q7Z739 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
YTHDF3Q7Z739 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
YTHDF3Q7Z739 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
YTHDF3Q7Z739 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
YTHDF3Q7Z739 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
YTHDF3Q7Z739 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
YTHDF3Q7Z739 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
YTHDF3Q7Z739 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
YTHDF3Q7Z739 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
YTHDF3Q7Z739 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
YTHDF3Q7Z739 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
YTHDF3Q7Z739 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
YTHDF3Q7Z739 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
YTHDF3Q7Z739 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
YTHDF3Q7Z739 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
YTHDF3Q7Z739 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
YTHDF3Q7Z739 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
YTHDF3Q7Z739 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
YTHDF3Q7Z739 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
YTHDF3Q7Z739 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
YTHDF3Q7Z739 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
YTHDF3Q7Z739 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
YTHDF3Q7Z739 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
YTHDF3Q7Z739 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
YTHDF3Q7Z739 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
YTHDF3Q7Z739 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
YTHDF3Q7Z739 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
YTHDF3Q7Z739 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
YTHDF3Q7Z739 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
YTHDF3Q7Z739 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
YTHDF3Q7Z739 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
YTHDF3Q7Z739 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
YTHDF3Q7Z739 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
YTHDF3Q7Z739 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
YTHDF3Q7Z739 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
YTHDF3Q7Z739 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
YTHDF3Q7Z739 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
YTHDF3Q7Z739 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
YTHDF3Q7Z739 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
YTHDF3Q7Z739 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
YTHDF3Q7Z739 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
YTHDF3Q7Z739 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
YTHDF3Q7Z739 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
YTHDF3Q7Z739 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
YTHDF3Q7Z739 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
YTHDF3Q7Z739 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
YTHDF3Q7Z739 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
YTHDF3Q7Z739 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
YTHDF3Q7Z739 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
YTHDF3Q7Z739 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
YTHDF3Q7Z739 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
YTHDF3Q7Z739 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
YTHDF3Q7Z739 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
YTHDF3Q7Z739 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
YTHDF3Q7Z739 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
YTHDF3Q7Z739 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
YTHDF3Q7Z739 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
YTHDF3Q7Z739 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
YTHDF3Q7Z739 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
YTHDF3Q7Z739 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
YTHDF3Q7Z739 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
YTHDF3Q7Z739 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
YTHDF3Q7Z739 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
YTHDF3Q7Z739 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
YTHDF3Q7Z739 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
YTHDF3Q7Z739 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
YTHDF3Q7Z739 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
YTHDF3Q7Z739 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
YTHDF3Q7Z739 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
YTHDF3Q7Z739 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
YTHDF3Q7Z739 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
YTHDF3Q7Z739 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
YTHDF3Q7Z739 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms