Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA2D4Q7Z3S7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms