Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms