Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms