Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
ZBED9Q6R2W3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZBED9Q6R2W3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZBED9Q6R2W3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms