Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBEC3HQ6NTF7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms