Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRNP1Q6NT89 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms