Protein–RNA interactions for Protein: Q69YH5

CDCA2, Cell division cycle-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA2Q69YH5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDCA2Q69YH5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDCA2Q69YH5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDCA2Q69YH5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDCA2Q69YH5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDCA2Q69YH5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDCA2Q69YH5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDCA2Q69YH5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDCA2Q69YH5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CDCA2Q69YH5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDCA2Q69YH5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDCA2Q69YH5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDCA2Q69YH5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDCA2Q69YH5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CDCA2Q69YH5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDCA2Q69YH5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDCA2Q69YH5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDCA2Q69YH5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDCA2Q69YH5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDCA2Q69YH5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDCA2Q69YH5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA2Q69YH5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms