Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLX4IPQ5VYV7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLX4IPQ5VYV7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLX4IPQ5VYV7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLX4IPQ5VYV7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLX4IPQ5VYV7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLX4IPQ5VYV7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLX4IPQ5VYV7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLX4IPQ5VYV7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLX4IPQ5VYV7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLX4IPQ5VYV7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLX4IPQ5VYV7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLX4IPQ5VYV7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLX4IPQ5VYV7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLX4IPQ5VYV7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLX4IPQ5VYV7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLX4IPQ5VYV7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLX4IPQ5VYV7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLX4IPQ5VYV7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLX4IPQ5VYV7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLX4IPQ5VYV7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLX4IPQ5VYV7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLX4IPQ5VYV7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLX4IPQ5VYV7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLX4IPQ5VYV7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms