Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GKAP1Q5VSY0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GKAP1Q5VSY0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GKAP1Q5VSY0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms