Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.03■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.02■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
COL5A1-AS1Q5SY13 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms