Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C10orf55Q5SWW7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms