Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHYHD1Q5SRE7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHYHD1Q5SRE7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHYHD1Q5SRE7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHYHD1Q5SRE7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHYHD1Q5SRE7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHYHD1Q5SRE7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PHYHD1Q5SRE7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PHYHD1Q5SRE7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHYHD1Q5SRE7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHYHD1Q5SRE7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHYHD1Q5SRE7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHYHD1Q5SRE7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHYHD1Q5SRE7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHYHD1Q5SRE7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHYHD1Q5SRE7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHYHD1Q5SRE7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHYHD1Q5SRE7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHYHD1Q5SRE7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHYHD1Q5SRE7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHYHD1Q5SRE7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PHYHD1Q5SRE7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PHYHD1Q5SRE7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PHYHD1Q5SRE7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PHYHD1Q5SRE7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PHYHD1Q5SRE7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms