Protein–RNA interactions for Protein: Q53RT3

ASPRV1, Retroviral-like aspartic protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASPRV1Q53RT3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASPRV1Q53RT3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ASPRV1Q53RT3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASPRV1Q53RT3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASPRV1Q53RT3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASPRV1Q53RT3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASPRV1Q53RT3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASPRV1Q53RT3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ASPRV1Q53RT3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASPRV1Q53RT3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASPRV1Q53RT3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASPRV1Q53RT3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASPRV1Q53RT3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASPRV1Q53RT3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASPRV1Q53RT3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ASPRV1Q53RT3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASPRV1Q53RT3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASPRV1Q53RT3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASPRV1Q53RT3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASPRV1Q53RT3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASPRV1Q53RT3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASPRV1Q53RT3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASPRV1Q53RT3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASPRV1Q53RT3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASPRV1Q53RT3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASPRV1Q53RT3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASPRV1Q53RT3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASPRV1Q53RT3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASPRV1Q53RT3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASPRV1Q53RT3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ASPRV1Q53RT3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ASPRV1Q53RT3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASPRV1Q53RT3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASPRV1Q53RT3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASPRV1Q53RT3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASPRV1Q53RT3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASPRV1Q53RT3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASPRV1Q53RT3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASPRV1Q53RT3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASPRV1Q53RT3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASPRV1Q53RT3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASPRV1Q53RT3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASPRV1Q53RT3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASPRV1Q53RT3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASPRV1Q53RT3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASPRV1Q53RT3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASPRV1Q53RT3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASPRV1Q53RT3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASPRV1Q53RT3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASPRV1Q53RT3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASPRV1Q53RT3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASPRV1Q53RT3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ASPRV1Q53RT3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASPRV1Q53RT3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASPRV1Q53RT3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASPRV1Q53RT3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASPRV1Q53RT3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASPRV1Q53RT3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ASPRV1Q53RT3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ASPRV1Q53RT3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ASPRV1Q53RT3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ASPRV1Q53RT3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ASPRV1Q53RT3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ASPRV1Q53RT3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ASPRV1Q53RT3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ASPRV1Q53RT3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ASPRV1Q53RT3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ASPRV1Q53RT3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ASPRV1Q53RT3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ASPRV1Q53RT3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ASPRV1Q53RT3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ASPRV1Q53RT3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ASPRV1Q53RT3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ASPRV1Q53RT3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ASPRV1Q53RT3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASPRV1Q53RT3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASPRV1Q53RT3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASPRV1Q53RT3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASPRV1Q53RT3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASPRV1Q53RT3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ASPRV1Q53RT3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ASPRV1Q53RT3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASPRV1Q53RT3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASPRV1Q53RT3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASPRV1Q53RT3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASPRV1Q53RT3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASPRV1Q53RT3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASPRV1Q53RT3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASPRV1Q53RT3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASPRV1Q53RT3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASPRV1Q53RT3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASPRV1Q53RT3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASPRV1Q53RT3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASPRV1Q53RT3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASPRV1Q53RT3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASPRV1Q53RT3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASPRV1Q53RT3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASPRV1Q53RT3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASPRV1Q53RT3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ASPRV1Q53RT3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms