Protein–RNA interactions for Protein: Q53QV2

LBH, Protein LBH, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBHQ53QV2 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LBHQ53QV2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LBHQ53QV2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LBHQ53QV2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LBHQ53QV2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LBHQ53QV2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LBHQ53QV2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LBHQ53QV2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LBHQ53QV2 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LBHQ53QV2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LBHQ53QV2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LBHQ53QV2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LBHQ53QV2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LBHQ53QV2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LBHQ53QV2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LBHQ53QV2 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LBHQ53QV2 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LBHQ53QV2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LBHQ53QV2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LBHQ53QV2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LBHQ53QV2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LBHQ53QV2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LBHQ53QV2 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LBHQ53QV2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LBHQ53QV2 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LBHQ53QV2 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LBHQ53QV2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LBHQ53QV2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LBHQ53QV2 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LBHQ53QV2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LBHQ53QV2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LBHQ53QV2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LBHQ53QV2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LBHQ53QV2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LBHQ53QV2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LBHQ53QV2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms