Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TMEM259Q4ZIN3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM259Q4ZIN3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms