Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCT8

KBTBD12, Kelch repeat and BTB domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KBTBD12Q3ZCT8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KBTBD12Q3ZCT8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KBTBD12Q3ZCT8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms