Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms