Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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