Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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