Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

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Length 1,122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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