Protein–RNA interactions for Protein: Q16777

HIST2H2AC, Histone H2A type 2-C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2ACQ16777 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIST2H2ACQ16777 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HIST2H2ACQ16777 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HIST2H2ACQ16777 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HIST2H2ACQ16777 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HIST2H2ACQ16777 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIST2H2ACQ16777 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIST2H2ACQ16777 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIST2H2ACQ16777 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIST2H2ACQ16777 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIST2H2ACQ16777 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIST2H2ACQ16777 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIST2H2ACQ16777 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIST2H2ACQ16777 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIST2H2ACQ16777 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIST2H2ACQ16777 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIST2H2ACQ16777 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIST2H2ACQ16777 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIST2H2ACQ16777 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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