Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LAMA4Q16363 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
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