Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNA6Q15825 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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