Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SIX1Q15475 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIX1Q15475 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
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