Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
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