Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RABEP1Q15276 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
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