Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARB2Q14108 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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