Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
COL4A6Q14031 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A6Q14031 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
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