Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CIRBPQ14011 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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