Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RUNX2Q13950 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms