Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms