Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALCAMQ13740 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
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