Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NAE1Q13564 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NAE1Q13564 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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